ООО "Томская нефть" было основано в 2001 году.
В 2004 году «Томская нефть» вошла в корпоративную структуру ОАО НК «РуссНефть». Интеграция в состав холдинга придала динамику реализации масштабных производственных программ, направленных на вовлечение в разработку имеющихся запасов и увеличение объемов добычи нефти на томских месторождениях. ОАО НК "РуссНефть" относит разработку лицензионных участков томского региона к числу наиболее перспективных для компании проектов и планирует на их базе обеспечить устойчивый рост добычи. Проведенная в декабре 2012 года оптимизация корпоративной структуры дала возможность объединить все томские активы холдинга на базе ООО «Томская нефть».
Существующая инфраструктура общества обеспечивает добычу, подготовку, транспортировку и сдачу нефти. Предприятие внедряет новые технологии в области бурения и добычи и обеспечивает экологически чистое производство.